Este es el Centro de Educación fundado por Cruzada Patagónica. Fue creado mediante un convenio con el Consejo Provincial de Educación del Neuquén, es totalmente gratuito y brinda albergue y comida a aproximadamente 200 jóvenes de ambos sexos. Con el objeto de brindar oportunidades también a los adultos, docentes especialmente capacitados visitan las comunidades para que puedan cumplir la escolaridad primaria.

Una de sus particularidades radica en que la enseñanza incluye no sólo inglés, informática y todas las materias oficiales, sino que también al ser un secundario agrotécnico (EGB3 y Polimodal) posee módulos educativos en: forestación, apicultura, huerta, ovinos, cerdos, aves e industrias de la granja, tractorista, motosierrista, carpintería e instalaciones eléctricas. Los jóvenes egresan como Técnicos Profesionales de Producción Agropecuaria.

El 95 % de los alumnos que egresan de la escuela obtienen trabajo.

Los docentes y directivos del CEI San Ignacio están convencidos de la importancia del trabajo educativo en vinculación directa con la comunidad. Por esta razón, los alumnos realizan continuamente prácticas laborales de aprendizaje-servicio junto a sus docentes en las comunidades rurales Mapuche y Criollas de la región. Con este espíritu se realizan prácticas de corte de pasto, arado de chacras, corte y acarreo de leña, instalaciones eléctricas rurales y urbanas, fabricación de aberturas de madera para los pobladores, asesoramiento en cultivos de invernadero y huertas, cosecha de miel, extracción de miel a terceros, asesoramiento a escuelas rurales primarias, etc.

Quienes han tenido la posibilidad de conocer al CEI San Ignacio en forma directa perciben, además de pasión, un método de enseñanza basado en el acompañamiento personalizado del alumno. Los docentes conocen no sólo a cada uno de los jóvenes que asisten a esta escuela agrotécnica sino también a sus familias, ya que en muchas oportunidades viajan con ellos cuando regresan a sus comunidades. Este contacto crea vínculos de confianza muy fuertes.